8 декабря 1997 года во время Тегеранского саммита ОИК Президент Азербайджанской Республики Гейдар Алиев встретился с Генеральным секретарем организации Изеддином Лараки. Во время беседы Изеддин Лараки заявил, что Организация Исламская конференция окажет всю необходимую помощь Азербайджану, не примирится с оккупацией его земель.

Глава Азербайджанского государства высоко оценил деятельность Изеддина Лараки в принятии ОИК решений, связанных с агрессией Армении против Азербайджана. Генеральный секретарь организации заявил, что ОИК полностью поддерживает позицию Азербайджана.

Во время руководства организацией представителем Турции Экмеледдином Ихсаноглу, избранным генеральным секретарем организации с 2005 года, между организацией и Азербайджаном было продолжено сотрудничество на высоком уровне.

В июне 2006 года с участием Экмеледдина Ихсаноглу в Баку была проведена 33-я встреча Совета министров иностранных дел Организации Исламская конференция. В этом мероприятии высокого уровня, впервые проводимом в Азербайджане, были приняты документы, поддерживающие Азербайджан в армяно-азербайджанском нагорно-карабахском конфликте. (http://www.oic-oci.org/)

На международной конференции, проводимой в апреле 2007 года в Баку, на тему "Роль средств массовой информации в религиозной толерантности" тоже принимал участие Генеральный секретарь ОИК. Все представители международных организаций-участников, включая Ихсаноглу, еще раз подтвердили то, что религиозная толерантность в Азербайджане находится на высоком уровне. (http://www.today.az/)

В ходе этой конференции Экмеледдин Ихсаноглу встретился с президентом Азербайджана Ильхамом Алиевым. В их беседе было заявлено о высоком уровне отношений между ОИК и Азербайджаном.

Президент Азербайджанской Республики Ильхам Алиев принял также руководителей Исламской организации по вопросам образования, науки и культуры (ISESCO) и Исламского форума молодежи. В это же время между ISESCO и Фондом Гейдара Алиева было подписано соглашение о сотрудничестве. (http://www.azerbaijan.news.az/)

Историческая справка составлена 10 мая 2007 года